Mer spesifikt hjernestammen, som også står for kontroll av hjerterytmen. Hjernestammen er helt sentral i det komplekse nettverket som utgjør nervesystemet vårt, da all informasjon til og fra hjernen går gjennom den. En annen emnerelevant del av hjernen er epifysen (glandula pinealis). Ofte omtalt som det tredje øye, er den for mange et fascinerende studie. En nok så kjent hypotese er at en større mengde naturlig (endogent) DMT vil produseres i epifysen ved en nær døden-opplevelse, og det er derfra man har at livet passerer i revý eller at man kan se/kommunisere med avdøde bekjentskaper på den andre siden. Det hevdes også at man kan stimulere det tredje øyet ved dyp konsentrasjon og meditasjon, og derfra høste tanker/visjoner av spiritualistisk natur. Rent fysiologisk er epifysen en hormonproduserende kjertel som er svært delaktig i å oppretteholde døgnrytmen vår. Hormonmessig er det hovedsaklig produksjon av melatonin den står for, og den stimuleres til å gjøre det av mørkets nærvær.